Baykar Teknolojileri'nde güvenlik araştırması, mülakat sürecinden önce başlatılmaktadır. Yüz yüze mülakata girmeden önce, adayların güvenlik araştırması yapılmaktadır. Eğer güvenlik araştırmasında bir sorun yoksa, aday mülakata davet edilmektedir. İşe başladıktan sonra ise ilk 6 ay boyunca detaylı bir araştırma yapılmakta ve belirli aralıklarla sicil sorgulamaları devam etmektedir.